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密闭离心机使用传统的机械密封，机械密封的优点是结构简单，技术成熟，加工精度要求低; 缺点是使用寿命短，功耗高以及须使用液体介质润滑和冷却密
密闭离心机使用传统的机械密封，机械密封的优点是结构简单，技术成熟，加工精度要求低; 缺点是使用寿命短，功耗高以及须使用液体介质润滑和冷却密封表面，生产过程中参数的波动对密封有很大影响。
密闭离心机主轴螺母、轴承位的密封，以前的传统机型在这方面的密封措施比较简易，只能做到相对密封。如主轴螺母部位，主轴螺母与转鼓接合面，一般不设置密封圈，离心机在运行过程中液相、气相渗入，对主轴锥面产生腐蚀，甚至渗入轴承中，对轴承产生破坏，从而影响机器的正常使用。上轴承盖一般都设置骨架式密封等结构，但上轴承盖与转鼓锥孔之间的一部分则暴露在外，离心机内腔中的气相，则可能对主轴暴露面产生腐蚀。制药行业所用的离心机，其所分离的物料中大都有机溶剂或酸、碱、盐等介质，因此在订购设备时应充分考虑到这些部位的密封要求，设置动密封或静密封结构，以达到密封要求。
密闭离心机其传动带是敞开式的，只是在电机端设置一防护罩，主要是从角度出发，以提高其使用性，但对于磨擦所产生的粉尘对环境的污染则没有加于控制，如在洁净区内使用是不可行的，因此，须对传动带工作区域密闭起来，以防止磨擦粉尘的外泄。
密闭离心机机盖因是可翻式，与机壳接合面应有可靠的密封措施，如果因密封结构或材质防腐失效，就可能造成液、气相的泄漏，对环境、人员造成伤害。密封槽结构、密封条的防腐性能，在设计与选用时应充分考虑其密封性能和可靠性能。对于进料管、洗涤管、观察镜等附加装置的安装接口，也应有可靠的密封措施。
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